A Secretaria de Estado de Ciência, Tecnologia e Inovação tem como missão elevar a capacidade científica e tecnológica em setores estratégicos para o desenvolvimento sustentável do Estado, por meio do planejamento integrado ao Sistema Estadual de Ciência, Tecnologia e Inovação em consonância com as Políticas Públicas Estadual.

Ser reconhecida pela sociedade como referência na formulação e implementação de políticas públicas de ciência, tecnologia, inovação e educação profissional.

Ética e transparência – Promover com ética e transparência o fortalecimento dos canais de comunicação entre a sociedade civil e o governo; Desenvolvimento sustentável – Promover o desenvolvimento econômico garantindo justiça social, equilíbrio ambiental e respeito à diversidade cultural; Trabalho e criatividade – Consagrar o trabalho como um valor essencial à vida humana e ter a criatividade como aliada para superar os obstáculos; Transversalidade - Refere-se à metodologia de trabalho que integra as instituições vinculadas à SECITECI e as demais secretarias resultando em otimização nos processos; Cultura da inovação - Fomentar iniciativas e mecanismos de processos criativos e sustentáveis, para geração de produtos e soluções.